故事以只有女性能使用的世界最強(qiáng)兵器「Infinite Stratos（IS）」為中心，在女尊男卑的世界中，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱 IS，為此他被強(qiáng)制進(jìn)入培育 IS 操縱者的學(xué)校「IS 學(xué)園」，周圍理所當(dāng)然也都是女性，而女生們也對(duì)這位「世上唯一能夠使用 IS 的男性」感到興趣，就此展開(kāi)了許多趣味橫生的學(xué)校生活。